在中国南海，与中国有领土争端的国家中，印尼实际上与中国没有领土争端只有海洋经济专属区划界的问题。
纳土纳群岛地理位置示意图
而印尼最担心中国的不是中国在南沙群岛的主权要求，而是中国对印尼的另一个群岛垂涎已久……这个群岛就是纳土纳群岛，其陆地面积是南沙群岛的1000倍，位置在南沙群岛曾母暗沙以南海域。
据日本媒体12月11日报道，印尼特种部队前指挥官卢胡特·潘查伊坦在华盛顿的战略与国际问题研究中心讲话时说：“印尼的主权是不容谈判的……在这一点上我们非常坚决。”
卢胡特说，在南中国海问题上，虽然印尼可以帮助弥合东盟国家与中国之间的分歧，但印尼也不会回避在自己的水域开发资源。
这点尤其是针对纳土纳群岛来说的，印尼一直担心该群岛周围部分水域与中国的“九段线”主张有重合。
卢胡特说：“至于纳土纳，我们很确定这是印尼的领土，到目前为止我认为没有任何问题。我想我们会去开发……天然气。”为什么印尼的特种部队军官要刻意强调纳土纳群岛是印尼领土呢？显然这是有争议的领土。
纳土纳群岛距曾母暗沙约400公里，与曾母暗沙纬度略同。距中国大陆陆地约1900公里，相当于广州到北京的距离。距加里曼丹岛最近之处225公里。1993年中国出版的一份地图把纳土纳列入中国版图，引起印尼强烈反弹，一度要求北京作出澄清。
北京并没有明确回复印尼，说明该岛仍然有着争议主权的地位。在以后适当的时机下，中国政府仍然有可能对纳土纳群岛申索主权。
2010年7月中国海军第6批护航编队航行至纳土纳群岛海域后，昆仑山号船坞登陆舰在该海域进行了两栖登陆演习。当时一度引起舆论的轩然大波。
印尼军官卢胡特说，印尼国家石油公司和美国雪佛龙公司在纳土纳群岛的合作有助于保护印尼的主权主张，因为有美国的参与。
卢胡特说：“这是目标之一，向中国放出信号：好了，你不能到这儿来，因为这里也有美国在。”
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