近日，中国环保部叫停了具有争议的重庆小南海水电站项目。这个水电项目曾受到重庆前市委书记薄熙来的力推，薄主政重庆期间，为了推进小南海项目，曾重划了鱼类保护区边界，好让水电站大坝可以开工。但如果大坝建成，长江中游最后一段自由流动河段就会被淹没，因此工程一直受到环保人士的反对。
有分析认为，环保部否决小南海水电项目虽是环保抗争的胜利，但也含有政治因素。如若薄熙来还主政重庆，这个结果可能不会发生，可能重庆政府还在力推这件事。“很难说这是一次胜利还是形势变化的风向标。”
综合媒体报道，环保部是在对有关金沙江乌东德水电站环境影响报告书的批复中做出的上述决定。环保部在批复文件中表示，“不得在向家坝水电站坝址至三峡水利枢纽库尾长江干流河段和支流岷江、赤水河河段等自然保护区范围内，再规划和建设小南海水电站、朱杨溪水电站、石硼水电站及其他任何拦河坝（闸）等涉水工程”。
环保部在批复文件中明确表示，长江上游的珍稀鱼类国家自然保护区在过去十年进行了两次调整，保护区结构和功能受到较大影响，今后要“严守生态保护红线”，“切实严格依法保护”这些自然保护区。
计划在重庆市区上游30公里处的中坝岛建设的小南海水电站曾被当地政府描绘为重庆市投资最大、装机规模最大和发电量最大的水电项目，能为重庆带来显著的经济效益。但中外环保人士一直对这个项目表示强烈反对。他们认为，水电站若建成，将对长江上游的水生生态造成毁灭性的破环。
一直关注中国小南海水电项目的国际环保组织“国际河流”的临时执行总裁皮特·博思哈尔德（Peter Bosshard）对中国政府的决定表示欢迎。他说：“我认为不继续推进这个项目是一个明智的决定。环保部明确表示某些环境保护的红线是不能跨越的，我们对此感到欣慰。我希望中国政府在未来的河流项目上也能考虑这一点。”
2009年，《中国日报》曾有报导指，小南海预选坝址位于重庆市珞璜镇下游1.5公里处，正处在长江上游珍稀特有鱼类国家级保护区的实验区，环保人士和鱼类专家纷纷抵制小南海大坝，认为这将给长江上游珍稀特有鱼类国家级保护区的鱼类带来灭顶之灾。
在薄熙来主政重庆之后，2009年6月17日，重庆市发展改革委网站上公布的《重庆市2009年能源发展报告》显示，“经过大量艰苦努力，2008年，国家发展改革委同意我市组织开展小南海水电站有关前期论证工作。长江上游珍稀特有鱼类资源保护、S106省道改线重建、白沙坨长江铁路桥拆除重建、移民调查专项工作进展顺利。三峡总公司小南海项目筹备组已完成工商登记，正式在渝办公。”
同年7月，重庆市发改委专门发文，为筹建长江干流上的小南海水电站排出了时间表：要求在2010年国家级自然保护区评审委员会换届之前，力争将涉及到的长江上游珍稀特有鱼类保护区调整报告，通过国家级自然保护区评审委员会评审。这份文件中写有：“如果保护区重庆境内范围和功能调整报告能通过评审，就标志著扫除了小南海水电站审批核准的障碍”。
以向家坝水电站蓄水发电为标志，2012年，规模空前的长江上游水电开发迈入新阶段，围绕梯级开发的地质风险和生态隐忧，各界争论不休，但到当年年底，小南海水电站的去留仍然未定。当时十多家中国环保组织和多名中国专家曾联名上书时任总理的温家宝，呼吁叫停 小南海水电项目的“三通一平”工程。
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