蔡英文（右一）与马英九（左一）一起出席2016年双十庆典（图源：中央社）
台湾民进党2016年选举，行政院与立法院获得双赢，但民进党执政后，碰上负面议题，民进党立委或绿营人士经常将责任归咎于前任马英九；绿委回应马英九相关新闻时，也多语带批评与讽刺。马英九因此被网友戏称，是台湾总统蔡英文最依赖的人。
据中国台湾网2月27日报道，最近一次绿营找马英九救援，是因为台军清泉岗空军基地染毒疑云。民进党立委蔡适应接受媒体访问时说，过去几年当局的反毒、防制毒品有加强空间，但这是长期累积下来的结果，不是蔡上任才发生;数据显示，台湾使用毒品问题过去7、8年来飙高，是前任马英九任内没有做好。
台湾《联合报》对马英九“救援”蔡英文事件进行了盘点。
马英九卸任后欲申请赴香港演讲，遭蔡英文办公室驳回。民进党立委庄瑞雄说，马英九根本没有想要出去，“是来乱的”，他担心马英九之后每30天就申请一次。民进党立委赵天麟批评，马卸任才27天就要到香港，是要挑战民进党底限。
2016年1月，马英九登太平岛宣示。身兼民进党中国事务部主任的绿委赵天麟说，民进党不接受、予以谴责，盼马在交接期间自持、保守。民进党立委林俊宪说，太平岛离我们这么远，是守不住的，马登岛是为了个人历史定位，若去将在历史上留下笑话。
2016年7月，“南海仲裁”前夕，民进党立委王定宇说，菲律宾提出的“南海仲裁案”5大重点，并无主权诉求，也未将太平岛列入裁定标的。所以如果问他“马英九卸任前，在那边忙什么？为何而忙？”，“我只能说鬼才知道!”
“南海仲裁案”结果出炉后，太平岛被降格为“礁”。民进党立委叶宜津说，“我觉得我们真的很倒霉，我们被马英九害了!”马英九的论述害了台湾，台湾在太平岛上建设、驻兵等是几十年的事实，但马英九却“偏偏要去那里讲我们就是中国的”。
台湾新当局上台一个多月，雄三飞弹误射。民进党立委陈亭妃说，马英九过去8年对大陆懦弱，让大家觉得防务已经不重要了，才引发今天的结果。
立院初审一例一休法案，民进党立委林淑芬批评马当初删除薪资门槛，是替企业降低引进白领的人事成本，完全是复制引进蓝领外劳的模式，满足企业对低廉人事成本的需求，罔顾对岛内劳动环境的冲击。
8月，蔡当局原欲派江春男任驻新加坡代表，但因江酒驾作罢。民进党立委黄伟哲说，外事场合喝酒要适量，“不要像马英九总是喝多、喝茫”。
9月，520后两岸关系差，陆客不来连带影响游览车、旅行社等行业。陆委会副主委邱垂正说，马当局没有做好风险控管，未及时提醒旅行业者，才导致现在状况。
2017年2月，驻日代表谢长廷日前拜访群马县厅，谈到日本五县市食品解禁问题，认为台湾内部目前无法理性讨论，建议缓一缓，引起岛内批评声音。谢长廷回应表示，外事官员只要发言就容易有争议，但他讲该讲的话，日本食物若符合国际标准就应该开放，个人的不安不该凌驾世界标准。他也认为当初马当局政策制定不够周延，五个县市被禁止的理由没有可依循的标准。
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