据载，最早到达菲律宾群岛的是三国时期的东吴。
公元226(吴孙权武五)年，东吴官员朱应、康泰巡抚东南亚，抵达过越南、柬埔寨和南洋群岛等地，也曾到过今天菲律宾境内的臣延、耽兰和杜薄。康泰回国后著有《吴时外国记》，可惜的是早已亡佚。
图巴塔哈群礁海洋公园。网络图
隋唐时期，中国航海业空前发展，南方大港泉州十分繁荣，海船和航海设备也大为进步，已出现了中国-菲律宾之间的较固定海上贸易航线。
此后几百年间，吕宋等地聚集起的不少华人，大都通过这条航线抵达的。他们在当地居住下来，有的经商，有的务农，有的甚至成为海盗。
十四世纪之前，菲律宾群岛上未形成国家，多以土著部落形式存在。
1390年，苏门答腊岛移民米南加保人建立了菲律宾历史上第一个国家---苏禄苏丹国。国境位于今菲律宾南部棉兰老穆斯林自治区西端的苏禄群岛，还有巴西兰省、塔维塔维省中间，巴拉望岛、婆罗洲北部及其他环苏禄海周围的群岛。首都位于和乐
公元1409年郑和三下西洋时路过苏禄，在和乐与苏禄第二代东王巴哈剌会晤，并赠对方丰厚礼物。叭哈剌对中国富庶繁荣十分仰慕，曾请求同船到中国朝觐观光”。
1417年，东王巴都葛叭哈喇、西王麻哈喇葛麻丁、峒王巴都葛叭喇卜率领家眷一行340人，前往中国进行友好访问，受到明成祖朱棣的盛大接待。
当使团回国行至山东德州时，东王巴都葛叭哈喇因病去世，按照他的遗嘱留葬中国。
明朝派礼部郎中陈士启前往祭奠，以国王礼节将扒哈剌葬于德州，并赐谥号“恭定”。
之后西王、峒王一行辞别归国，而东王一家除长子都马含回国嗣位外，其余家属都留德州守墓（这些人在雍正时期获得中国国籍）。
17世纪，满清王朝建立，苏禄苏丹国国王（东王后裔）遣使“朝贡”，重建了和中国的“藩属”关系。
1753(干隆十八)年，苏禄“老苏丹”上《请奉纳版图表文》，请求将本国土地、丁户编入中国版图，这是因为苏禄被西班牙步步蚕食。
但此时干隆正奉行闭关锁国政策，最终婉言拒绝。
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