1996年，共军在台海进行导弹演习，李登辉揭穿中共军演丑闻，指共军发射的是“空包弹”。
李登辉在1996年推动台湾举行首次总统直接选举，当时中共花费40亿在台海进行导弹演习，试图施压台湾，但遭到美国警告。时任中共党魁江泽民担心惹恼美国，下令演习使用没有弹头的导弹。李登辉获得情报后安抚台湾民众说：不用担心，共军放的是“空包弹”。据传，李登辉揭穿中共军演丑闻，江泽民被气得直拍桌子。
1996年，台湾举行首度总统直选，北京为吓阻台湾的本土派势力，将其它区域的兵力全部移防部署于面对台湾的沿海区域，并在台海进行导弹演习，引发台海危机。
中共军方最初的部署是实弹射击、越过海峡中线、动用潜舰、攻占外岛。整个演习的预算超过40亿人民币以上。
但美国政府警告中共“如果演习出现问题，会造成不可预计的后果”。同时，美方还派出“独立号”和“尼米兹号”两个航空母舰战斗群在台海附近游弋，震慑中共。
中共时任党魁江泽民不敢和美国搞僵，又害怕台海真的爆发冲突会令军方趁机坐大，自己成空头军委主席。于是在中共政治局扩大会议上，江抬出邓小平的“韬光养晦”政策，提出3点主张：导弹不飞越台湾、战机和军舰不过海峡中线、不占外岛。
当时中共军方的行动方案、以及共军发射的导弹没有装上弹头等极度机密信息，被中共少将刘连昆报告给了台湾当局。刘连昆是两岸第一位同时拥有少将待遇的军官，也是两岸有史以来最高级别的王牌间谍，化名高至明。
据台湾《苹果日报》报导，共军总后勤部军械部部长刘连昆在1992年9月被台湾军情局吸收，当时已官至少将的刘连昆因不满中共官场贪污盛行，加之对共军六四事件极为反感。因此，当被台湾军情局策反的共军大校邵正宗找上他时，决心投诚。
1996年3月7日，李登辉在宜兰进行选举前的拜票活动时，为稳定民心，他公开透露共军在台海演习的弹头是“空空的哑巴弹”，是吓唬人用的“空包弹”。据传，李登辉一句话，气炸江泽民。江气急败坏认为有人泄露军事机密，下令彻查。
直到1998年，两名台湾军情局官员叛逃北京，中共根据他们出卖的情报清查内部，有将近200名中共军官受到审查，30多人被判刑入狱，刘连昆和邵正宗二人被枪决，刘连昆的儿子被判刑15年。
台湾军情局将刘连昆和邵正宗二人以“烈士”名义供奉在忠烈堂内。当时担任刘连昆联络人的台湾情报人员杨铭中也被捕，台湾方面曾积极营救杨铭中，提出交换俘虏，但被中共拒绝。
杨铭中先是被判死刑，后改为死缓，最后是减到有期徒刑20年，于2019年1月23日获释返台。
自从1996台海危机之后，共军再没有以发射导弹威胁台湾。而当年的导弹危机也变相为李登辉“助选”，让他得票过半，顺利当选第一任民选的中华民国总统。李登辉于7月30日晚间7时24分在台北荣民总医院过世，享寿97岁。
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