针对总统大选选后局势，海基会董事长洪奇昌认为，在国民党总统候选人马英九胜选后，国民党肩负起治理国家的重担，民进党则必须有效监督。洪奇昌说，在国家认同上，八成左右的民意是维持现状，执政的国民党不该悖离主流民意，此外，选后国、民两党当务之急，应该是培养新一代的人才。
洪奇昌认为，大选结果大致符合他对选情的评估，他分析选后局势，提出三点意见：
一、政治制度从少数政府到一党完全执政
过去8年，民进党政府选择少数执政的方式，无法与在野党联合执政，现在尝到少数执政的苦果。因为朝小野大的关系，政策、法案无法有效推动，政绩自然无法展现，这一点朝野都应该检讨。
马英九胜选后，国民党达到「完全执政」，跟过去8年少数政府的宪政结构并不相同，过去少数政府面临到的困难，未来将迎刃而解。洪奇昌提醒国民党不要太高兴，他说，展望未来，国民党政府治理的能力将备受考验，不能推诿塞责，并且展现多数充分尊重少数的态度。
未来民进党只剩余国会四分之一席次，要把忠诚反对党这个角色扮演好，发挥有性能有品质的监督能力。民进党退居反对党的角色，但也不至于妄自菲薄，或非常失意，想当年建党初期，民进党也是绝对的少数，当初席次跟现在差不多弱势，但是在国会的问政上还是大有可为。
洪奇昌认为，只要民进党核心价值跟路线正确，未来民进党还是大有可为，过去民进党的核心价值分清楚，表现也很亮眼，未来只要能把持住正确的核心价值，政治路线符合多数期待，就算只有四分之一席次，还是可以有很好的表现。
二、选后国、民两党应注重新一代人才培育
洪奇昌说，期待两党在未来政治局势下，着重新一代人才培育。他说，国民党显然比较糟糕，执政4、50年，这次推出的副总统候选人萧万长，8年前也是副总统候选人的身分，在培育新一代领导干部这一点上并不及格。
至于民进党更应该放多一点心力，谢长廷落选后将退出政坛，未来将由新的人领导民进党、竞争大位，民进党要着重心力在这部份，他不希望以后还是同一班人站在领导位置。另外，民进党选后要重整、检讨，这是分重要的事。
三、国民党不能背离「维持现状」的主流民意
在国家认同部分，洪奇昌认为，台湾人民中将近八成认同现状，表示多数人对国家认同是趋近的，国民党胜选，不该背离这样的主张，必须维护台湾共同的利益，往人民期待的方向去走。因应这样的趋势，针对两岸、国防、外交等问题，朝野应该共同做决定，国民党要释出诚意跟沟通的善意，共同体认民意。
洪奇昌说，选举完了，希望大家冷却选举激情，只要是台湾人民共同选出的政府，就是全民的政府，只要是台湾人民共同选出的总统，就是全民的总统，应该不至于会有出卖台湾之事。
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