台湾在南美洲唯一的邦交国巴拉圭新总统卢戈当选后即表示想于中国大陆建交。此举被视为可能与台湾断交的前兆，为此陈水扁24日致电卢戈，邀请卢戈择期率团莅台访问。
由于卢戈对外表示希望与中国大陆发展进一步关系，在其以总统当选人身分召开的第一次记者会更强调，“巴拉圭人民与国会议员当中，有与中国建立更紧密关系的期盼”，使得台湾与巴拉圭的邦交出现警讯。不过，台湾驻巴拉圭大使胡正尧在该记者会后已经首度卢戈会面，亲自把陈水扁祝贺鲁戈当选的电文送达。
总统府24日下午进一步指出，陈水扁已于上午透过电话向卢戈致贺，并期盼台巴两国的传统友好合作关系，能更臻密切与稳固。
陈水扁表示，台巴建交已51年、逾半个世纪，邦谊世笃，各项合作项目进展顺利，也使台巴人民互蒙其利，未来台湾政府愿与巴国新政府继续加强各项交流，也盼就未来台巴合作架构展开进一步磋商。
卢戈总统当选人则对陈水扁的致电申致谢忱，并感激兄弟之邦台湾政府及人民对巴国的长期关心与协助，即使台巴距离甚远，但人民之间的情感却非常亲近，他盼望未来台巴能强化彼此关系，也亲自感谢陈水扁致力深化台巴关系的贡献，并表达巴国对台湾人民的祝福之意。
陈水扁响应表示，好友不必言谢，好朋友就是当朋友有困难时，随时与他在一起，并随时给予拥抱，这些都是台湾政府与人民应该做的事。
陈水扁并邀请卢戈总统当选人择期率团莅台访问，实地了解台湾政经现状与各项建设的发展成果，陈水扁最后也再次祝贺卢戈总统当选人与巴国人民成功完成民主选举，并盼望台巴邦谊永续长存。
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