外传国民党基层串联修改党章，力拱马英九回任党主席，总统府发言人王郁琦6月23日强烈否认。王郁琦指出，「党政分离是马英九的理念，完全不考虑」，对於国民党秘书长吴敦义的相关说法，总统府则不愿多做回应，仅说「外界怎麽会有这种想法？」
为了破除外界疑虑，23日马英九主持上任后首次的总统府月会时，亲自邀请国民党主席吴伯雄参与，并特意安排吴伯雄坐在第一排、副总统萧万长旁边。吴伯雄是所有出席人士中，唯一一位不具公部门职务的「民间人士」。幕僚指出，这可以解读为总统以实际行动破解不利传言的做法。
对於基层力拱马英九重掌党部，吴敦义上午在立院受访表示，不少党代表主张透过修改党章让总统回任党主席，但以总统的高度参选党主席，恐怕外界观感不佳，若透过全代会修改党章、通过特别条款，保留未来总统兼任党魁的弹性，总统或许会有不同的考量。国民党将於十月十一日召开全国党代表大会。
对於这项说法，党中央不愿意发表任何意见，仅表示「主席知道这个新闻了」，府方对此则进行全面消毒。王郁琦说，马英九完全不可能考虑回任党主席，党政分离是他的理念，不了解外界怎麽会有这种想法。他强调，马、吴沟通非常好，对於吴主席带领国民党打两场胜仗，马英九非常尊重。
尽管出现拱马回任党主席的传闻，但马吴两人的互动依然良好，府院党高层五人便当会，今日中午照例在总统办公室举行，马、吴仍然就国内各种局势广泛交换意见。至於马英九是否会以实质行动化解党中央内部矛盾？释出执政资源让国民党充分参与？仍待持续观察。
东森新闻说，王郁琦下午向媒体表示，吴伯雄今年带领国民党打赢两场选战，对国民党贡献很大，马总统相当尊重，没有必要在此时做这样的议题。王郁琦强调，党政分离是马总统坚持的理念，除了在竞选期间多次提出，选后也在不同场合谈到同样的想法。对於不兼任党主席，马总统非常明确地表态过很多次，不会因为今天的新闻而改变。
王郁琦说，马总统「从来没想过要兼任党主席，这件事情是他不会考虑的」，「马总统不会希望兼任党主席」。如果当党代表修改党章力拱马总统回任党主席的话，府方人士说，「不会让它发生」。
此外，媒体并报导由於总统府遵守党政分离，马总统下乡刻意和党务系统切割，王郁琦则说，马总统最近下乡主要是和过去的老朋友叙旧，以及了解弱势团体需求，不是政治或竞选活动，并没有刻意要求地方党部配合。
至於马总统今天中午和萧万长副总统、行政院长刘兆玄、立法院长王金平以及吴伯雄的例行便当会，王郁琦说，会中针对钓鱼台议题，以及考试委员、监察委员被提名人如何争取立法院的支持，广泛交换意见，但他并未转述具体内容。
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