昆明事件再次将“恐袭”严峻地摆在朝野各界面前，国人也再次审视中国的反恐体制和机制。
2001年“9·11”事件后，中国成立了国家反恐怖工作协调小组，组长由公安部长担任。国家反恐怖工作协调小组下设办公室，简称国家反恐办，主任由公安部副部长担任，与公安部反恐怖局合署办公，但不归公安部管理。国家反恐办大约每两年开一次全国反恐怖工作会议。
2013年8月，中国反恐体制升级，原来的国家反恐怖工作协调小组升级为领导小组，现任公安部部长郭声琨担任反恐领导小组组长。国家反恐怖工作领导小组下设办公室，还叫国家反恐办，主任仍由公安部副部长担任。
升级后的反恐领导小组，虽然还是国务院议事机构，但已从协调变成领导，可以直接下达命令，直接指挥各个反恐单位。北京观察家指出，毫无疑问，新成立的反恐领导小组将变成新组建的国家安全委员会重要成员，毕竟反恐是确保国家安全的重中之重。
在 2008年北京奥运前和奥运期间，反恐曾经是中国公安部门的头号任务。但奥运以后，影响社会治安的警民群体冲突、袭警事件占据了媒体更多版面，吸引了民众 的眼球，致使反恐似乎退居次位。但实际上，公安部门对反恐这根弦一丝也不敢放松。
2001年美国“911”事件发生后，中国很快发现：反恐的一个基本特点，就是单凭一个国家的力量难以进行，因为恐怖分子往往分散在各个国家，其经费、武器来源往往有多个渠道。这样“反恐”是中国参与国际事务的机会，尤其是可以借此拉近与美国的关系。
在这种情况下，中国反恐获得了有利的契机，除了与美国合作外，还加强了与中亚各国的合作，以铲除“东突”势力生长的土壤。
就在“911”事件发生后不到一个月，中国即着手建立一套“全方位、多领域、全国性”的反恐和危机处理机制。在中央层面上，成立了反恐协调领导小组。地方层面上，各地的反恐协调领导办公室（协调小组）陆续成立，一些地方还组建了反恐部队，配备了警用直升机。
国家反恐怖工作协调小组组长由时任中共中央政治局委员、公安部长的周永康担任，周永康后来升任政治局常委、政法委书记，仍分掌反恐工作。国家反恐怖工作协调小组下设办公室（国家反恐办），与反恐怖局合署办公。国家反恐办大约每两年开一次全国反恐怖工作会议。
反恐工作的具体执行者，起初来自公安刑事侦查系统，在五局（刑侦局）设有反恐怖处，处长何挺。2001年末，公安部新设立27局（反恐怖局），制定反恐怖预桉，掌握、分析反恐怖信息，专责反恐协调、指导以及统领全国的反恐行动，首任局长也是何挺。
公安部现任常务副部长杨焕宁，分管反恐工作。
杨焕宁由于曾任中央新疆工作协调小组成员、中央西藏工作协调小组成员、中央对外宣传工作领导小组成员，有丰富的处理疆独、藏独及国际公关经验。杨焕宁参与设计、制订了中国反恐系统，提出了中国反恐政策：“立足预防、主动出击、高效处置、加强国际合作”。
2005年，中央为令杨焕宁补足地方工作履历，调其出任黑龙江省委常委、政法委书记。杨焕宁到哈尔滨后不久，亲自设计指挥了“2006·黑龙江省级反恐指挥系统演练”，15支反恐应急处置力量参加的这次演练，给其它地方反恐演练树立样板。
在“藏独”、“疆独”骚乱频生之际，杨焕宁受命回京，出任正部级的公安部常务副部长，专责奥运保安，防范“藏独”、“疆独”的恐怖袭击。
周永康的“政法帮”分崩离析之际，知情人士也透露杨焕宁曾遭到约谈。 （《调查》15期叶茂之 刘子威）
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