1999年3 月，对曾庆红来说是一个成熟的时机，分管组织人事的胡锦涛当选为中央军委副主席，曾庆红开始接替早已超龄的张全景兼任中共中央组织部部长。宗海仁指出，曾庆红接任中央组织部的根本目标，就是全面主导十六大人事，尽可能大面积地安插江派人马，并为自己捞取最实用的政治资本。
曾庆红特别强调要对高级干部特别是一把手实施监督，并倡议中央组织部与中纪委联合，每年定期派出巡视组赴各地各部门，重点对省部级官员特别是党政一把手执行 “党的路线方针政策及对中央批示、交办的各项工作落实情况，贯彻执行民主集中制、选择任用干部和廉洁从政等情况进行监督检查”。并依照有关法规和要求， “严格规范领导干部廉洁从政行为，积极推行省部级现职领导干部家庭财产报告制度，扩大领导干部任期经济责任审计制度的适用范围，在省部、地厅级领导干部中 进行离任经济责任审计的试点。”这些措施，使省部级官员的贪渎腐败行为有所收敛。
与此同时，曾庆红将触角伸向外事系统，对外事干部人事制度进行改革。将选派驻外使节的人选，由外交部内部改为面向全国选才，通过组织推荐、资格审查、综合考 试、面试、考察和审定等六个步骤，首批选出十二人。2001 年3 月19 日，12 人赴任之际，曾庆红亲自与其面谈，进一步展示了曾庆红的魄力。总的说，曾庆红在组织系统的改革是比较得人心的。
在负责筹备中共十六大人事方面，曾庆红已经大面积地提拔了江泽民的人马和他自己的亲信。在十六大中央委员会中，我们看到一长串新的中央委员或候补委员名单，他们都是属于江泽民和曾庆红的：王刚、习近平、薄熙来、赵启正、李铁林、白克明、刘京、陈良宇、孟建柱、王歧江泽民和 曾庆红在十六大前山、周小川、乔宗淮、栗戎生、刘源、黄丽满等等。
客观地说，这些人中的大部分是年富力强、有政绩，又与江曾关系极好的现任省部级官员。但的确也有少数不是靠政绩，而是完全凭江泽民的面子。
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