人脑中的松果体具有与我们眼睛非常相似的结构。它的功能也与眼睛惊人的相似。这个腺体的细胞就像我们的视网膜一样，有光受体的作用，其结构与玻璃体相当。玻璃体是我们眼睛视网膜和晶状体之间的凝胶状物质。松果体中也存在类似晶状体的东西。
科学家们仍在研究松果体。它在东西方信仰体系中都被称为人类意识的所在地。东方唯心论认为，眼睛以孔径——穴位的形式存在于全身。西方科学也开始认识到，松果体是一种“第三只眼”。
多年来，科学家们认识到松果体和我们的眼睛有许多相似之处。1919年，弗雷德里克‧蒂尔尼（Frederick Tilney）和路德‧菲斯克‧沃伦（Luther Fiske Warren）写道，那些相似之处证明松果体是光敏的，并且可能具有其它视觉能力。
更近一点的，在1995年，南加州大学细胞和神经生物学系主任谢丽尔‧克拉夫特（Cheryl Craft）博士写了一篇关于所谓的“心灵之眼”的文章。
“在蜥蜴头骨的皮肤下，有一只光敏的‘第三只眼’，这……相当于人脑中被骨包裹的分泌激素的松果体。人类松果体不能直接接触光线，但就像蜥蜴的‘第三只眼’一样，它在夜间会增强其激素，褪黑激素的释放”，她写道，“松果体是‘心灵的眼睛’。”
一束神经纤维将松果体连接到“后连合”（the Posterior Commissure，大脑中尚未得到充分理解的部分）。
在1950年代，研究人员发现了松果体能够感知光线，并可以产生与其感知到的光水平相对应的褪黑激素。因此，它控制着体内重要的节律，并影响生殖和免疫系统。松果体以前被认为是一个退化了的器官，处于休眠状态。而这一发现表明，它实际上具有重要的功能。
2013年5月，另一项发现也可能改变人们对松果体的理解。
人们发现，老鼠的松果体会产生N，N-二甲基色胺（DMT）。这是生物体产生的一种色胺类致幻剂，但人们对此没有很好地理解。这很有趣，因为众所周知，摄入DMT可以诱发精神上强烈的迷幻体验。
里克‧斯特拉斯曼（Rick Strassman）博士在美国政府的批准下，于1990年代在新墨西哥大学进行了研究。他将DMT注射到人类志愿者体中。斯特拉斯曼称DMT为“精神分子”。
密歇根大学（the University of Michigan）的季莫‧博尔济金（Jimo Borjigin）博士和路易斯安那州立大学（Louisiana State University）的史蒂文‧巴克（Steven Barker）博士证实了DMT在大鼠松果体中的存在。他们的研究部分由斯特拉斯曼博士领导的卡顿伍德研究基金会（the Cottonwood Research Foundation）资助。该基金会支持对意识本质的科学研究。他们的研究发表在《生物医学色谱》（Biomedical Chromatography）杂志上。
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