教皇本笃十六世结束在德国巴伐利亚的访问前，特地赶往雷根斯堡大学做了一场演讲。不料，这个演讲惹出麻烦，洋洋万言报告的一开头，教皇便谈到基督教同伊斯兰在暴力问题上的根本分歧。
教皇说，宗教不应成为滥用暴力的辩护工具或者自身站出来公开呼吁使用暴力。他引述了拜占庭皇帝Manuel II.Palaeologos 同一名波斯智者就“圣战”和使用暴力进行的对话。教皇说，书中写道，皇帝说，默罕莫德给世界只带来了糟糕的东西和非人道的东西。
教皇此言一出，立即招致伊斯兰大会组织（OIC）的批评。该组织包括了57个穆斯林成员国，周四晚他们在沙特阿拉伯宣称，伊斯兰大会组织希望，这不会是梵蒂冈对付伊斯兰新政策的开始。尤其是在梵蒂冈同穆斯林宗教学者以及主要思想家进行了数十年的对话之后，这种变化更不可想象。伊斯兰大会组织甚至说，教皇就默罕莫德的引言是对其的诽谤中伤。
无独有偶。巴基斯坦议会就本笃十六世教皇的言论进行了抗议。周五，该国议员在伊斯兰堡一致通过了一项决议，呼吁天主教会的最高领袖收回他的讲话。决议写道，教皇的傲慢言论伤害了穆斯林世界的情感。“本着宗教间和谐共处的利益”，他应该收回他的言论。
与此同时，土耳其宗教界领袖以及极富影响的埃及穆斯林兄弟会也发出呼吁，要有伊斯兰世界抗议教皇言论，埃及穆斯林兄弟会甚至要求教皇检讨他的讲话。该会负责人说，如果教皇不收回他的讲话，伊斯兰国家将结束同梵蒂冈的关系。“一个对西方公众社会发生影响的教廷最高人物，会说出这样的话来。”
在德伊斯兰组织也对教皇讲话感到愤怒。在德穆斯林中央委员会秘书长马泽克对每日镜报说，他很难相信，教皇恰恰选择了暴力这一点说明伊斯兰同基督教之间的区别。人们只要还记得十字军东征或者在西班牙发生的强行让犹太教徒、伊斯兰教徒改变其信仰的历史，就足矣！恰恰是伊斯兰要求人们胸怀理智，伊斯兰法庭的判决从来就将“使用自己的头脑”作为支柱之一。
教皇周四晚已回到梵蒂冈官邸。鉴于多个伊斯兰机构的批评，教皇的代言人出面讲话，他说，教皇决无羞辱穆斯林教徒之以意。教皇引用的话，只是为了替主题服务。他的用意决不是在说，整体的伊斯兰世界富有暴力倾向。
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