日本国会图书馆29日向国会提出有关靖国神社当年战犯合祀的数据集，使得战犯合祀的内幕首度曝光。数据显示，靖国神社1969年曾与当时的厚生省开会讨论甲级战犯合祀问题，当时也明示可以合祀的甲级战犯名单。
据日本媒体报道，国会图书馆公开的数据集中共有808件，其中179件是由靖国神社提供，包括合祀资格审核和合祀手续等首次公开的文书，被视为是记载甲级战犯合祀经过的重要资料。
这些数据集中记载许多首度曝光的靖国神社决定合祀对象的经纬，虽然没有明显写出背后是日本政府主导合祀一事，但数据显示，旧金山合约签订后，当时的厚生省与靖国神社接触频繁，经常交换意见，包括针对战犯是否可与战死者合祀的事进行讨论。
资料集还显示，1958年4月的讨论会上，厚生省方面曾对靖国神社方面表达，能否能将乙级战犯以不显眼的方式纳入合祀。1959年，乙、丙级战犯就纳入神社奉祀。
《朝日新闻》说，这份资料是靖国神社所典藏的《靖国神社合祀者资料审查方针记览》的一部份。日本政府在1956年起的三年之间积极推动合祀，1958年4月9日在靖国神社的办公室内召开讨论合祀基准的会议。当时有旧厚生省官员四人、神社方面五人、奉赞会相关人士六人出席。甲级战犯于1978年合祀，但名簿在1966年2月就送抵靖国神社方面。
根据这份新资料，厚生劳动省方面1969年1月31日与神社方面针对十二名甲级战犯的奉祀做出“合祀可”的同意，文书中的“再确认事项”中记载，“法务死殁者”“甲级（十二名）”及“内地未处决死殁者（十名）”“合祀可（认可甲级战犯合祀）”，并指示“避免对外发布”，可看出当时对舆论的动向仍有所顾虑。
在1970年6月25日的会议中，因顾虑到内外局势而并没有马上做出决定合祀的结论。最后1978年合祀的甲级战犯共有十四名，其中包括在远东国际军事审判中的“未处决拘留中死亡”的前外务大臣松冈洋右，以及“内地未处决死殁者”前海军大臣的永野修身。
另据国立国会图书馆公开的一份盟军最高司令部（GHQ）解密文件记载，时任日本首相的吉田茂即将于1951年参拜靖国神社前夕，GHQ民间情报教育局由于担心军国主义死灰复燃，且为了避免此事给反对占领的共产主义势力提供“宣传材料”，曾在文件记录中写道，文部省应劝说首相放弃参拜。
文件指出参拜会增强右翼势力的气焰，并令人对宣称政教分离原则的日本政府产生质疑，而且容易被外界看作美国为了收买盟国日本而采取的机会主义。文件认为有必要采取平等对待一切宗教的“中立”方式追悼战殁者。
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