日本共同社9月23日文章称，中国海监和渔政船反复巡航钓鱼岛海域让日本政府疲于应对。尽管有日本外务省干部称“这是中国的挑衅行为”，但目前并无办法阻止船只驶入“领海”。如此下去，坚持钓鱼岛“不存在争议的固有领土”的日本政府立场或被动摇。然而，若动用“防卫力量”加以对抗则势必引起军事紧张。因此，野田政权正处于风口浪尖之上。
文章称，野田就钓鱼岛问题一直表示：“双方都强调‘寸步不让’是没有意义的，为平息事态需要双方一起努力”，唿吁应通过冷静对话打开僵局。但野田并没有解决问题的具体方案，仅表示“坚决维护领土、领海的主权”，强调不能让步。日外务省就有声音认为，野田如果示弱，“必将遭到来自国内的勐烈抨击”。日政府相关人士也称：“不能轻易妥协，目前只能不断唿吁中方进行对话，暂时放置中国船只问题。”
文章指出，野田政权在是否动用自卫队阻止中国船只驶入“日本领海”问题上态度慎重，防相森本敏也仅称：“将继续进行警戒和监视，并将所需信息通报相关省厅。”官房长官藤村修也没有要求防卫省官员出席18日在首相官邸召开的相关省厅会议。
一名日外务省政务高层对此分析称：“这是给中国政府的信息，即不应让军方参与。”这一“排除防卫省”的做法意在避免刺激中国采取派遣军舰等“极端措施”。
9月18日，12艘中国船只在钓鱼岛附近海域巡航，其中3艘曾一度进入12海里海域。截至23日上午，有20艘中国船只先后进入钓鱼岛附近海域巡航。日国土交通相羽田雄一郎表示担忧称：“要做好长期化的准备，应密切关注对方的动向并强化海上保安厅的警备态势。”
共同社文章坦言，日方对钓鱼岛的“实际控制”已经动摇，对于“没有做到实际控制”的指责，日外务副大臣山口壮20日在记者会上艰难地辨称，没听说除中国以外的其他国家登陆钓鱼岛，从这个意义上来说，“日本有效控制着岛屿”。21日，外务报道官横井裕对此解释称，钓鱼岛“不存在领土主权问题，但发生各种事态也是事实”。
不过，对于中国船只反复进入钓鱼岛海域巡航，一名前驻华大使认为，“如果20、甚至30艘船只像在本国领海内航行那样(靠近岛屿)，就应该认为(日本)对岛屿的实际控制已经动摇了，或者正在动摇”。
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