埃及最高宪法法院首席大法官曼苏尔(Adly Mansour)4日宣誓就任临时总统，取代了被军方罢黜的莫西总统。在莫西被废除后仅数小时，穆斯林兄弟会的高层成员纷纷遭到埃及军方清算和入狱。埃及政局在两年半内发生两次巨变，社会对立和撕裂严重，国家未来的前途更加莫测难料。
但埃及5日各地上午已传不同暴力冲突。埃及「国家支持合法性联盟」组织唿吁全国各地的民众5日祈祷结束后，举行名为「周五拒绝」的和平抗议，谴责对民选政府发动军事政变，支持莫西总统的合法地位。该联盟是由包括穆斯林兄弟会在内的伊斯兰政党组成的。这将是对军方在罢黜莫西之后，如何稳定局势的一大考验。军方已唿吁各方克制。
欧巴马总统也在国庆日当天在白宫战情室再度召开紧急国安会议，听取各方简报。白宫会后发表声明再度要求尽快恢复民选政府。
曼苏尔4日在最高宪法法院宣誓典礼上说：「我宣誓捍卫共和国体系，遵守宪法与法律，保卫人民利益。」就职仪式由国营电视台现场直播。曼苏尔也意识到兄弟会的重要性，递出和平橄榄枝。他表示，穆斯林兄弟会是埃及人民的一部分，欢迎他们协助「建国」。他说，「穆斯林兄弟会也是埃及人民，我们邀请他们参与国家建设，因为没有人会被排除在外。我们欢迎他们接受邀请。」但军方在推翻莫西后，没有对兄弟会留情，大肆拘捕该组织高层。穆斯林兄弟会的一名发言人哈达德早些时候告诉「英国广播公司」(BBC)说，莫西已被软禁，「整个总统班底」都被拘禁。军方已向大约300名穆斯林兄弟会的其他成员发出逮捕令。好几家同情穆斯林兄弟会的电视台也被中断广播，一家国营印刷社据报已经开始拒绝印刷自由与正义党办的一份报纸。
BBC引用埃及官员透露的消息指，兄弟会最高领袖巴迪(Mohammed Badie)已在开罗以西的沿地中海城市被捕。另一名富商萨特(Khairat al-Shater)也被捕，此人是巴迪副手，但实际被视为莫西背的最有力支持者之一，指控他们「教唆杀害示威群众」。这说明军方与新政府对兄弟会追杀到底情况，将展开更广泛的镇压。
埃及2011年爆发的民主运动，推翻了前总统穆巴拉克的长期统治，穆斯林兄弟会在随后的大选中获胜。如今，民选的莫西总统又被推翻，穆斯林兄弟会成员被监禁的地点，正是当年关押穆巴拉克的囚牢。
尽管临时总统曼苏尔表达和解之意。但兄弟会似乎排除与对方和解的可能性，认为军方干预是政变，推翻合法民选总统。兄弟会执行委员会成员艾巴尔说：「我们拒绝与任何不合法的政权合作。」
莫西的伊斯兰支持者聚集在解放广场，表示除非被暴力赶走，否则将一直坚守到莫西总统的合法地位得以恢复。他们高唿﹕「走狗对我们发动了政变，我们为真主而死，将无比崇高。」
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