穆尔西尽失民心,亦得不到军方支持,注定总统梦碎。在众叛亲离下,军方曾以安全离国、豁免起诉等条件诱使他自动落台,穆尔西都坚决说不,以一句「踏过我的尸体吧」回应,结果遭军方软禁。
穆尔西所属穆斯林兄弟会有成员说,早在反对派周日(6月30日)爆发大示威前一周,败象已露端倪,「我们在6月23日就知道完蛋了」,当时军方要求穆尔西和反对派在七天里化解分歧,很明显是不可能的任务。
风雨欲来,总统和军方越行越远。先是部队军车悄悄部署到全国主要城市,情报官员不上报,穆尔西完全蒙在鼓里。穆斯林兄弟会的办公室被示威者袭击洩愤,警方也拒绝提供保护。
穆尔西作最后挣扎,跟国防部长塞西、总理甘迪勒开紧急会议,但会上穆尔西只顾强调自己是民选总统,对民众关心的物价飞涨、失业高企、电力短缺等问题置之不理。他又想在军中拉拢盟友跟他站在同一阵线,亦告失败,没有军人支持他。
兄弟会发言人阿里说︰「我们太天真……没想过被背叛得这么彻底。」塞西已决定了穆尔西的命运,摊牌说一是坐牢,一是他自己宣布辞职,「他两样都不肯,不想再把国家交到军人手中」。
6月30日全国示威后穆尔西大势已去,他跟家人翌日避入专责保护总统的共和国衞队总部内,助手致电西方政府求救徒劳无功,然后军方随即发出48小时最后通牒。
国营《金字塔报》报道,军方曾以安全送穆尔西到土耳其、利比亚,或是豁免起诉换取他辞职,他都一一拒绝。周二晚他发表「坚持到底」的演说后随即遭军方管制,周三下午总统的最后一道保护线──共和国衞队成员亦离弃穆尔西,任由他被军方带到秘密地点软禁。