疆独问题未解，维吾尔伊斯兰激进势力发动闹市杀人等的抗争活动日趋暴戾下，极端分子接受ISIS训练后回流中国会构成怎样影响，已成为中国官民关注的议题。
新疆的维吾尔族分离分子向来埋怨北京高压政策，而圣战者想推翻的叙利亚政府，则拥有中国等重要盟友。ISIS领袖巴格达迪（Abu Bakr al-Baghdadi）7月1日在网上鼓励穆斯林参加圣战的录音中，便曾称ISIS战士源自中国等12国，中国是「霸佔穆斯林权利」的国家之首。
ISIS首领点名中国压迫穆斯林
维吾尔人在中东助战早自阿富汗抗苏时代，2006年美国也曾拘拿22名跟盖达有关系的维吾尔人。中国中东问题特使吴思科在7月下旬表示，据外国传媒报道数据，以维吾尔族人为主约有100名中国人正在中东受训或参加战斗。新疆问题专家潘志平更称，那些人的主要受训目的「始终是回到中国作战」。
伊拉克国防部本月3日透过facebook发放两张宣称「中国人ISIS」的照片，左臂上有一个黑底白字ISIS纹身标志的照中男子貌似汉人。伊拉克国防部没说有何证据表明该战士是中国人。中国外交部未能证实相中人身分。
专家质疑华刻意挂鈎
英国的国际安全研究专家潘图奇（Raffaello Pantucci）称，中国担心圣战者回国的原因，与西方国家担心他们回国的一样，但「他们对中国的威胁可能小得多」，因为无从确定在叙利亚打仗的维吾尔族来自中国而非土耳其，而且「从叙利亚返回中国的旅途十分艰难，要在途中不引起人们注意，不被中国边界或其他地方的卫兵抓住是相当困难的」。有专家质疑中国蓄意将ISIS和维吾尔人、支持疆独的东突厥组织挂鈎，旨在合理化狙击疆独活动。
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