虽然菲律宾同中国在南海部分海域存在领海主权争议，但马尼拉仍在最后一刻决定加入中国主导的亚洲基础设施投资银行。
菲律宾政府周三（2015.12.30）表示，该国总统阿基诺已向财政部签发了指令，授权其签署《亚洲基础设施投资银行协定》。签署该协议的期限截止到本周四。菲律宾财政部长普里斯马（Cesar Purisima）表示，亚投行是一个面对投资需要的机构，它将有助于填补许多国家的资金空白。
菲律宾将成为亚投行57个创始成员国中的最后一个。今年12月25日，《亚洲基础设施投资银行协定》达到生效条件，亚投行由此正式成立。按照该协定的条款，菲律宾必须在今后5年内向该行提供1.96亿美元的基金。总部设于北京的亚洲基础建设投资银行共有运作资金总额1000亿美元。
菲律宾财长普里斯马还表示，作为亚投行创立成员之一的菲律宾，希望在基础建设方面得到技术支持，扩展相关的工业领域并提高就业以及其他贸易机会。
目前，菲律宾同中国在南海的主权争议依旧激烈。北京称享有南海绝大部分领海主权。2013年菲律宾将南海案呈交位于海牙的常设国际仲裁法院。今年10月底，该法院做出裁决称有权审理此案。而中国则表示拒绝参加该案的听审，坚称南海案不属于国际仲裁法院管辖的范围。
除中国和菲律宾外，对南海声称享有部分主权的国家和地区还有文莱、马来西亚、台湾、越南。据信该海域海底矿产和渔业资源均非常丰富，也是重要的国际海上通道，全球石油运输的三分之一必须经过这里。
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