教育部长吴茂昆29日请辞获准，多个教育团体表示不适任教长"已耽误全国教育41天"，并认为吴下台是行政院长赖清德表示负责；作家龙应台则沉痛表示，吴茂昆是该走，因为他根本就不应该上台，但科学家培养不易，吴茂昆下台除了他自己极度缺乏政治智慧，但最可恶的是任命他的民进党政府。
台大代理校长郭大维昨天仅在受访时表示"祝福吴部长"，未再回应。另根据亲近管中闵的知情人士表示，管中闵日前已有耳闻，对此并不意外，但因吴茂昆并非政治拍板拔管的要角，管中闵不必也不会对此表示意见。
国教行动联盟、中华语文教育促进协会及各县市家长协会等全国共31个教育团体29日发表联合声明，重批吴茂昆失德、失格、失职、失言、失态，完全不适任教育部长，已耽误全国教育41天，对于吴下台，除了表示欢迎，也肯定行政院长赖清德愿意负责。
"不意外但又很意外！"多次参与台大自主联盟活动的台大政治系教授苏宏达表示五味杂陈，一方面为吴茂昆感到惋惜，吴茂昆毕竟也是个院士，当过国科会主委、中研院所长，这都是学术界很高的荣誉，却被糟蹋掉；他也感慨现在的政府对人才、对学者，不管是管中闵、吴茂昆，都是用权谋去计算，相当不尊重。"看不到国家大的政策，令人忧心，却用这么大的力气去拔管！"
但苏宏达也认为吴茂昆请辞不表示民进党政府要清理拔管战场，因此也不期待政府会改变，毕竟管中闵人事案不只是教育部的事。至于台大自主联盟该走的节奏还是会继续走，"我们是坚持一个价值和制度。"
作家龙应台则在脸书沉痛表示，每个重要科学家都是"国家的宝贝"，吴茂昆的折损，肇因民进党政府草率行事，事先不做功课，查清对象的行事风格及"清白"细节，争议风雨中，仓促出手；她并恳求蔡总统不要败坏台湾教育："请为台湾保住一块净土"龙应台表示，她看到消息很伤痛，"他（吴茂昆）该走，因为他根本就不应该上台。"
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