世界卫生组织（WHO）周三（5日）发布第16期武汉肺炎疫情报告，将台湾列在中国大陆的栏目内，注明是“台北及周边地区”（Taipei and environs）。台湾外交部表示严正抗议，已要求世卫更正。大陆国台办周四（6日）发声明，指摘台湾的民进党利用疫情趁火打势、“以疫谋独”的行为，是不会得逞。
该份报告将台湾置在大陆各省市区，包括香港、西安的下方，同时在附注加上文字说明：“中国确诊病例包括香港特别行政区、澳门特别行政区与台北及周边地区。”
世卫近日多次修改对台湾的称呼，在上月22日的第2期报告中，将台湾称作“中国，台湾”（Taiwan, China），翌日另一份报告改称为台北直辖市（Taipei Municipality），同月25日再改称台北（Taipei），并将台湾病例算入大陆的总数内。
国台办的声明指出，台湾民进党当局和台独分裂势力在这次疫情期间，伺机鼓噪所谓台湾参与世界卫生组织议题，企图拓展所谓台湾的“国际空间”。但根据世卫组织法，任何有关台湾参与国际组织活动的问题，都必须在一个中国原则下解决。声明重申台湾在获取这次疫情信息方面不存在障碍，所谓“国际疫情缺口”，只是民进党的卑劣炒作。
台湾陆委会周四下午回应国台办“以疫谋独”的言论，指大陆的政治操作、无理打压，用片面政治主张排除台湾参加世卫，已明显违反世卫宪章与国际关系原则。陆委会表示，大陆政权不能代表、矮化台湾，吁世卫不应单为大陆的政治意志服务。同时，陆委会又呼吁大陆勿将政治因素凌驾在人类健康安全之上，称这无助改善两岸关系。
世卫组织周四在日内瓦召开会议，陆方代表团指摘美国等，在会上炒作台湾议题，浪费大会时间。陆方代表强调台湾是中国一部分，台湾问题是中国内政，希望有关国家严格遵守规定，停止炒作台湾议题。
此外，世卫负责人接受周三大陆官媒访问，赞赏陆方兴建“方舱”医院隔离患者的做法。世卫将派出由多个国家、领域的专门人才组成的专家组，前往大陆学习抗疫经验。
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