在轰动一时的国安部间谍案传出后，第一个“躺著中弹”就是现任副部长邱进，据知情人士透露，传闻称那个被美国中央情报局策反的间谍正是邱进的秘书后，这让当时正负责处理王立军案件的邱进非常郁闷。
在原重庆市副市长、市公安局长王立军叛逃美国领馆后，就有网友在第一时间爆料称，当时中央派到成都处理这起突发事件的正是国安部副部长邱进，也是邱进劝说王立军离开美国领事馆，并直接把王带回北京。
邱进的身分被曝光后，他的个人经历也被网友“人肉”出来，称其是“团派大将”，1978年进入中国人民大学党史系学习，毕业后进入共青团中央学校部，后为副处长，并担任全国学生联合会副秘书长，当时正是胡锦涛、王兆国、刘延东、李克强、李源潮等人主政团中央期间。
1987年6月，在胡锦涛调往贵州任省委书记前，批准邱进调任共青团北京市委副书记，同时仍兼任全国学联副秘书长。一般认为，他与曾担任北京团市委书记的贾春旺关系密切，在贾春旺担任国安部长期间逐步晋升。2000年升任局长时，虽然贾春旺已交棒给许永跃，但贾是公安部长，影响犹在，邱进继续受到重用。2002年，邱进升任国家安全部部长助理、八局（即主管对外国间谍的跟监、侦查、逮捕的反间谍侦察局）局长，后任国家安全部副部长，副总警监警衔。
不过，据北京可靠消息来源称，国安部副部长邱进也曾一度传出是“间谍嫌疑”，甚至还传出他已被抓的消息，但后来证实这些只是传言。但也有传闻称，邱进的确差点被抓起来，并不是因为间谍案，而是得罪了王岐山，向外界透露了王岐山的私人生活，以及贪污腐败等“谣言”，激怒了王岐山。然而，来自北京政法系统的可靠消息指，邱进目前“已被监控起来，随时都会被抓”的原因，却与他对王岐山造谣的传闻无关，而是他也深度捲入了周永康案。
据北京消息人士证实，2012年下半年一度传出邱进因周案而受到调查的消息，“其实对邱的调查仍在继续，尤其是在周永康的干儿子孔涛被抓、北京市国安局局长梁克被正式逮捕后，从目前看，邱进跟孔涛和梁克都有直接关系，甚至邱的问题可能要比孔梁都严重，所以北京国安系统一直都在传说，邱进落马只是时间问题。”
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