曾庆红跟随江泽民进京之后，1993年，正式担任中央办公厅主任，便将他上海的老部下施芝鸿延揽门下，算是“借调”。施芝鸿后来回忆：“那一年，我借调到北京工作，住在满山红叶的西山风景区。这里，从早到晚的唯一功课便是看书写作。”
长年从事文字工作，施芝鸿健身之道是散步。他说，这一习惯源于就是借调期间，当时担心消化不良，每天散步，白天陶醉于“西山枫叶红似火”，晚间尽情领略“明月松间照”的意境，自感身心大有益处。坚持几年，效果是：精力充沛，工作效率大大提高，偶尔外出旅游，爬山气不喘，远足脚不累。
在京期间，施芝鸿和已任《人民日报》副总编辑的周瑞金继续合作，合写《上下一心，打好今年改革攻坚战》的评论文章，在《人民日报》刊出，获得第五届“中国新闻奖”言论类的一等奖。
习近平尽管拥抱曾庆红，但是对曾塞给自己的施芝鸿，习并不欣赏。
1995年，施芝鸿返回上海，担任浦东新区管理委员会政策研究室主任、中共浦东新区党校常务副校长。1998年，由台湾《中国时报》主办的“台、沪、港经贸关系研讨会”在台北召开，施芝鸿以“浦东发展研究中心主任”身分赴会，当时他作为曾庆红手下红人的名气尚未传开。
不久，施芝鸿正式上调中央，担任曾庆红政治秘书，成为曾庆红讲话稿的把关人，官拜中央办公厅调研室政治组组长。2002年中共十六大召开，施是十六大报告起草小组成员。随著曾庆红政治权力增大、官场地位提升，施芝鸿也水涨船高，升任中办调研室副主任，随侍左右。
曾庆红不仅自己使用施芝鸿，在2007年中共十七大上交卸职务之后，又郑重其事地将施芝鸿推荐给了接任的中央政治局常委、国家副主席习近平，施又成为习近平讲话的“文胆”之一。施芝鸿先后参加了十六大、十七大和十八大主要文件的起草，还参与了中共十五届六中全会、十六届四中全会、十七届四中全会和十七届六中全会文件的起草。
但是，消息人士称》，习近平只是在不长的一段时间使用施芝鸿，随后就不再用他。2013年春天，时年62岁的施芝鸿当上了全国政协委员、社会和法制委员会副主任。
3月5日，施芝鸿正是以这个身分为曾庆红辩护。
分析人士指出：曾庆红一度炙手可热，无论在党、政、军，还是企业、文化……都有极其深广的人脉，其党羽遍布，触角伸到党内各大派系，然而，在习近平步步紧逼、重重围困之下，曾庆红处在危难之中，这些党羽却都明哲保身，装聋作哑，深怕引火上身，无人出手相援为曾庆红缓颊。只有一个施芝鸿，奋不顾身地出来声辩，力陈不能对中纪委文章中的“庆亲王”胡乱猜疑。真不知道，曾庆红是会为“门前冷落鞍马稀”的世态炎凉而喟嘆？还是该为关键时刻唯一肯发声的施芝鸿的耿耿丹心而感动？
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