面对靠推特治国的川普总统，国防部长马提斯近两年来在不违背命令的同时，致力于重建美军军力，他不顾川普的反对向阿富汗增兵，在叙利亚和伊拉克打击伊斯兰国(IS)取得进展，和从国会得到更多军费。但马提斯宣布辞职和川普将对国防部进行调整，将使五角大厦在一定时期内面临不确定性。
川普不顾军方反对，下令从叙利亚撤军，同时从阿富汗撤出近半数美军，导致马提斯愤然辞职。川普把马提斯的辞职提前两个月，任命代理部长在1月1日履职。
川普就任总统之初倚重军方，他的风格和物色的人选得到军方支持。他签署旅行禁令时有多位退役将领环绕，显示旅行禁令得到军方背书。
杜克大学的专家费佛(Peter Feaver)曾表示，美军的军费多年来被削减，如今川普终于赢得军方的支持。
军方目前的高层是在九一一恐怖攻击后成长起来的，北约国家九一一后派出大批部队与美军并肩作战，但川普却质疑北约，威胁要放弃与南韩，怀疑美军应继续留在中东。
马提斯担任国防部长期间，不断地让自己适应川普的美国优先，在川普提出五角大厦的重点要转为对付俄罗斯和中国后。马提斯认为，川普的意思是指如果飞机遇险，要先自己戴上面罩，才能去救其他人。
国防部官员不适应川普自行在推特宣布政策，包括停止军援巴基斯坦、禁止跨性别者服役和建立太空军，认为决策缺乏预见性。多数人还担忧，美军传统的政治中立可能受到威胁。
美军去年准备空袭叙利亚时，川普曾问"军方谁负责上电视谈空袭？"在马提斯和国防部其他领袖表示异议后，最终是时任国安顾问麦马斯特身穿军服，出现在电视上。
对于川普要求美军参与许多有争议的计画，包括大规模阅兵、在美墨边界部署现役部队，五角大厦在私底下都持保留意见。
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