新冠肺炎疫情仍在日本不断扩散，相较于日本首相安倍晋三，此次官房长官菅义伟却鲜少在幕前曝光，然而有自民党干部透露，此次在防疫时之所以看不见菅义伟作为中央协调人的活跃身影，是因为“和安倍之间有裂痕”，同时也凸显出目前日本政府“安倍独大”的决策变化。
根据日本《共同社》报导，第二届安倍政府上台后不久，在2013年1月发生的阿尔及利亚人质事件，从此事件开始，菅义伟就长期负责政府的危机管理应对，在2016年熊本地震等多次自然灾害的救灾活动也是在前线指挥。不过此次在应对新冠肺炎时，“新型冠状病毒特别措施法”由安倍出身派系、自民党细田派的经济再生担当大臣西村康稔来应对，口罩缺货等问题则由首相助理和经济产业省负责。
然而近期的“日本国民统一发放10万圆补贴”政策协调过程中，菅义伟主张应该给真正困难的人发放补贴，像是给收入减少的家庭发放30万圆等措施，不过在公明党强烈要求之下，局势也顺势改变，然而菅义伟和公明党的主要支持体“创价学会”关系密切，却也未见菅义伟居中协调。
日本政府人士透露，体现菅义伟成为“局外人”的就是“10万圆补贴”的政策协调过程。《共同社》则指出，菅义伟与安倍之间的“距离感”，可说是围绕着“后安倍时期”的首相后继人选的观点分歧。
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