检察官选择对马英九特别费案上诉，就司法独立的角度，检察官上诉与否根本不该与马英九是否控告检察官有任何关系，但就政治面分析，检察官上诉，让马英九提告的争议性相形降低，绿营天王因此仍陷在特别费烂泥里，对马英九大选就算不是利多，也不是坏事。
在二审无罪后，马英九选择控告、举报检察官，引起法律人、政治人泾渭分明的正反看法，法律人认为马英九不因无罪就和稀泥值得喝采，政治人忧心此举会为大选横生枝节，态度保留，但检察系统则传出原本有意不上诉，却因马英九告官出现变数的第三种说法，选择当法律人提告的马英九，在此政治回应上因此选择低调。
外界也传出，检察系统不是上诉，就会在放弃上诉时统一见解，「统一」的方向则是将特别费全数视为实质补贴，检方的说法是如此也可帮余文请求法院改判无罪；这样说法基本上是一种「全或无」的思考，换言之，检察系统显然认为：要嘛，就所有蓝绿天王及余文都继续被特别费缠身，要嘛，就蓝绿大小一起解套。
然而，不论是台北地院的一审判决，还是高院的二审宣判，都认为领据部分是实质补贴，核销部分仍应依法报销，检察官的统一见解刻意跳过这种可能，还宣称放弃上诉是为被告利益，且有助余文改判无罪，让人俨然有检方拿余文案，要交换绿营天王特别费、甚至是国务机要费一案的意味，其中政治考量的斧凿痕迹斑斑。
检察官今天决定上诉，看来马英九的告官确实打乱了检察官要找下台阶的一盘棋，但也印证马英九不因二审无罪就在人权和稀泥的决定，不无道理，因为，既然检察系统可以为政治考量决定上诉与否，也难保其原本统一见解的盘算，不会在最后一刻因其他「政治力」介入生变。
尤其，在二审宣判前，检察系统仍持续放话要重新侦办早已查过的马英九其他特别费案，马英九实无和检察官和稀泥的空间，既然三审已不影响大选选局，让「法律的归法律、政治的归政治」，还是最好的选择。 （原题：检方陷泥淖 马已立于不败 ）
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