九合一选举，民进党惨败，行政院长赖清德在脸书宣布请辞，负起政治责任。他说，"九合一大选，是人民对政府施政的检验，而投票的结果，显示人民并不满意。对此，我感到抱歉，已向蔡英文总统口头请辞，负起政治责任。"
回顾过去年的县市长选举，蓝绿执政时期，都曾有时任行政院长率内阁总辞的例子，以示对选战负责。而民进党在这次完全执政下，原有执政13县市大缩水，且在现有4都执政权又丢了台中市、高雄市，如今赖清德也确定请辞负责，绿营人士预料，总统府祕书长陈菊的市府团队都已前进中央，因此菊姐接任的可能性很高，就看她的健康状况是否容许。
前总统陈水扁2004年连任后，民进党却在2005年县市长选举中大败，仅取得6席，而在野的国民党取得彰化、南投及花莲以北全部县市长及嘉义市长、澎湖县长共14席。因此时任行政院长谢长廷2006年1月率内阁总辞，以示负责。
马英九同样在2012年连任总统后，在2014年县市长选举仅取得6席，民进党主责打出"地方包围中央｣口号，加上太阳花学潮助攻，赢得全国13县市大胜。国民党惨败，时任行政院长江宜桦也率内阁总辞，由副院长毛治国暂代阁揆。 这次九合一地方选举，视为总统蔡英文的期中考， 原有执政13县市大缩水，现有4都执政权又丢了2都。
有绿营人士指出，台中、高雄都输，赖清德请辞后，谁接行政院长也是很大的问题，而陈菊接任院长可能性不小。
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